Se han corregido muchos fallos en esta versión (ver change log).
Solo tienes que descomprimir el fichero descargado y subir el archivo es_ES.mo al directorio /wp-content/themes/mystique/lang/ de tu instalación de WordPress.
Descarga: Traducción “es_ES” para Mystique 3.0.8
Si todavía no estás usando la versión 3 del tema Mystique, puedes descargarlo desde aquí.